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Affymetrix公司研制了全球首张基因芯片，发表顶级杂志最好最多，最受国际认可，市场份额最高，是最知名的芯片公司。

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Notch信号靶标基因表达PCR芯片包含了Notch经典信号通路的转录因子和研究验证得到的高关联性靶标基因，通过该芯片得到的结果可用于Notch信号传导激活和抑制研究。

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连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。人类连锁分析芯片实验表明其成功率为99.8%，重复性>99.9%。

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小鼠全转录本表达谱芯片，约有4个探针来针对每个外显子 / 约有40个探针来针对每个基因，覆盖经验性及预测的外显子序列，约1000000个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。

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该芯片可以检测约23,000个牛的转录子，对应19,000个同源基因。

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